SZTE TTIK
Biokémiai és Molekuláris Biológiai Tsz.

Genomikai/szekvenáló laboratórium


A Genomikai laboratóriumban a genomikai és funkcionális genomikai vizsgálatokhoz egy Illumina MiSeq új generációs (NGS) DNS szekvenáló berendezés, valamint számos kisegítő műszer áll rendelkezésre.

A MiSeq a piacvezető Illumina cég leghosszabb szekvenálási reakciókat (2x300 nukleotid) biztosító berendezése, maximális kapacitása futásonként 15 Gb. A MiSeq támogatja a kétoldalról történő (paired-end) szekvenálást, a szekvenáló reagens megválasztásával a leolvasások száma (1M - 25M leolvasás / futás) és hossza (2x50 - 2x300 nukleotid / leolvasás) az adott alkalmazásnak megfelelően széles körben változtatható.

A MiSeq platform számos genomikai ill. funkcionális genomikai alkalmazásra ad lehetőséget, mint például:

  • de novo bakteriális genom szekvenálás
  • célzott újraszekvenálás
  • metagenomika (16S amplikon szekvenálás)
  • SNP analízis
  • transzkriptomika (RNA-seq)
  • miRNS analízis
  • ChIP-seq

A laboratórium további kiegészítő műszerei:

  • Covaris M220 ultraszonikátor
  • Agilent Bioanalyzer 2100 kapilláris gélelektroforézis készülék
  • Thermo Scientific PikoReal 96 és ABI 7500 real-time PCR gépek
  • Qubit 2.0 fluorométer
  • NanoDrop spektrofotométer
  • SciGene Hybex Microsample Incubator
  • Biosan MPS-1 Multiplate shaker
  • Biosan UVT-B-AR PCR kabinet

Amennyiben kutatási koopráció keretében vagy szolgáltatásként igénybe szeretné venni a laboratórium szolgáltatásait, kérjük érdeklődjön Dr Bodai Lászlónál vagy Dr Boros Imrénél.






SZTE TTIK Biokémiai és Molekuláris Biológiai Tanszék
2013-2015.